پرداخت مالیات و ارزش افزوده

سلام ما یک کسب و کار راه اندازی کردیم
حوزه فعالیت ما مشاوره و انجام کارهای رایانه ای و هوش مصنوعی هستش
شرکت مسئولیت محدود ثبت شده و همه گام های مودیان رو رفته و حساب حقوقی براش باز کردیم.
با یک مجموعه قرارداد ساخت یک سامانه هوش مصنوعی بستیم، تمام موارد مالی در قرارداد ذکر شده و شماره حساب شرکت جهت پرداخت انجام شده، از طرفی حقوق و هزینه سرور و مابقی اطلاعاتی که باید پرداخت کنیم رو هم مشخص کریدم، حالا مرحله بعد چیه و باید کجا این اطلاعات رو ثبت و مالیاتش رو پرداخت کنیم؟
ما شنیدیم کارهای نوآورانه معاف از مالیات هستش، چطور میتونیم معاف بشیم اما اطلاعات کاری که داریم میکنیم رو ثبت کنیم؟؟!