فاکتور رسمی و ارزش افزوده

من برنامه نویس هستم، یکی از شرکتها که قرارداد برنامه نویسی باهاشون دارم و پیش پرداخت قرارداد را چندماه قبل واریز کرده، میگوید برای قرارداد فاکتور رسمی که داخلش ارزش افزوده هم اضافه میشه براش صادر کنم و 9درصد ارزش افزوده هم بهم میده
من چون در سامانه مودیان، زدم مشمول ارزش افزوده نمیشوم ، قبول نکردم، اما میگوید سیستم حسابداریشون اجازه نمیده و حتما باید فاکتور رسمی + ارزش افزوده را بزنم براشوم.

سوالی که دارم اینه که اگر من فاکتور رسمی صادر کردم، آیا عواقبی برای من داره؟
با توجه به قوانین ارزش افزوده که تقریبا همه مشاغل را شامل می شود، با صدور این فاکتور ممکنه من را برای پرداخت ارزش افزوده شناسایی کنند و هم جریمه پرداخت نکردن ارزش افزوده این قرارداد و دیگر قراردادهایی که داشتم این مدت را از من بگیرند؟